微通道换热器有多种分类方式，常见的如下：
按外形尺寸分类
微型微通道换热器：主要为满足电子工业发展需求而设计，结构紧凑、轻巧、高 效。常见结构形式有平板错流式微型换热器、烧结网式多孔微型换热器。可选用聚甲基丙烯酸甲酯、镍、铜、不锈钢、陶瓷、硅、Si₃N₄和铝等材料。
大尺度微通道换热器：应用于传统的工业制冷、余热利用、汽车空调、家用空调、热泵热水器等领域。结构形式有平行流管式散热器和三维错流式散热器。主要材料为铝及铝合金。
按通道结构分类
平行流微通道换热器：内部流道呈平行排列，流体在各通道内平行流动，具有流动阻力小、换热均匀等特点，在空调、制冷等领域应用广泛，如汽车空调的冷凝器和蒸发器常采用这种结构。
交叉流微通道换热器：流体在不同通道内以交叉的方式流动，能增加流体间的混合和传热效果，适用于对传热效率要求较高、流体物性差异较大的场合，在一些化工工艺换热、能源回收等领域有应用。
螺旋流微通道换热器：流道呈螺旋状，使流体在流动过程中产生旋转和离心力，增强了流体的扰动和传热系数，可有 效提高换热效率，且具有较小的占地面积，常用于空间有限、对换热效率要求高的场景，如小型紧凑式热交换系统。
按传热原理分类
间壁式微通道换热器：温度不同的两种流体在被壁面分开的空间里流动，通过壁面的导热和流体在壁表面的对流，实现两种流体之间的换热，如常见的微通道管壳式换热器、微通道板式换热器等。
蓄热式微通道换热器：通过固体物质构成的蓄热体，把热量从高温流体传递给低温流体。热介质先通过加热固体物质达到一定温度后，冷介质再通过固体物质被加热，以达到热量传递的目的。
流体连接间接式微通道换热器：把两个表面式换热器由在其中循环的热载体连接起来，热载体在高温流体换热器和低温流体之间循环，在高温流体处接受热量，在低温流体换热器把热量释放给低温流体。
按应用领域分类
电子设备冷 却用微通道换热器：用于计算机芯片、激光器等高功率密度电子设备的散热，要求具有高散热效率、快速响应等特点，能在小体积内实现高 效的热量传递。
空调与制冷领域微通道换热器：如家用空调、汽车空调的蒸发器、冷凝器等，需要在不同的工况下实现高 效的制冷或制热，对换热效率、耐腐蚀性等有较高要求。
能源领域微通道换热器：在太阳能热水器、地源热泵、燃料电池等能源设备中，用于实现热量的转换和传递，以提高能源利用效率。
化工与制药领域微通道换热器：在化工生产中的反应热交换、精馏过程，以及制药行业的药品生产过程中的温度控制等环节发挥作用，需要满足不同化学物质的腐蚀性、工艺温度和压力等要求。
